Francesco Maria di Francia nació el 19 de febrero de 1853 en Mesina, Reino de las Dos Sicilias, el menor de los cuatro hijos de Francesco di Francia (quien murió cuatro meses antes de que naciera Francesco) y su esposa, Anna Toscano. Sus hermanos mayores fueron, por orden de nacimiento, Giovanni, Maria Caterina y Annibale (Aníbal). Aníbal fue canonizado en 2004.
Cuando su madre se vio incapaz de cuidar de todos sus hijos, ella envió a Aníbal y Francesco al cuidado de una tía anciana. Ella, a su vez, los envió con su tío paterno, el sacerdote Raffaele di Francia. El padre Raffaele se convirtió más en un padre para los niños que en un tío, y se aseguró de que recibieran una sólida educación matriculándolos en el Colegio de los Padres Cistercienses. También influyó en su eventual decisión de convertirse en sacerdotes.
Aníbal tenía un temperamento más parecido al de su padre, mientras que Francesco se sentía más atraído por las bellas artes, especialmente la música y la poesía. Francesco escribió una vez una canción corta en honor a su santo patrón, San Francesco di Paola.
Durante su camino al sacerdocio, Francesco dudó en ocasiones de que ser sacerdote fuera su verdadera vocación, e incluso consideró dedicar su vida a la música. Sin embargo, decidió que su llamado al sacerdocio era genuino y fue ordenado el 18 de diciembre de 1880 en la iglesia de San Pablo de Mesina por el arzobispo Giuseppe Guarino (actualmente Siervo de Dios).
Influenciado por su hermano Aníbal, el padre Francesco desarrolló una gran sensibilidad y compasión por los pobres y marginados. A finales del verano de 1887, por ejemplo, una epidemia de cólera azotó Mesina, y el arzobispo le dio permiso para cuidar a los enfermos. Así lo hizo durante toda la epidemia, y en 1888 comenzó a atender a niños enfermos en el hospital de la ciudad.
Además de sus deberes pastorales, el padre Francesco también impartía clases de teología moral a seminaristas en Mesina.
En 1896, el padre Francesco conoció a una mujer llamada Natala Briguglio, quien lo animó a fundar una nueva orden religiosa femenina. Así, en 1897, el padre Francesco fundó las Hermanas Pobres del Sagrado Corazón, que más tarde se llamarían Hermanas Capuchinas del Sagrado Corazón. La primera miembra de la nueva orden fue Natala Briguglio, conocida como Hermana Verónica di Gesù Bambino.
El 28 de diciembre de 1908, un fuerte terremoto azotó Mesina, y el padre Francesco, junto con su hermano Annibale, ayudó en las labores de rescate y reconstrucción de la zona.
El 28 de febrero de 1912, el arzobispo nombró al padre Francesco vicario general de la arquidiócesis. A pesar de sus nuevas responsabilidades administrativas, el padre Francesco continuó predicando y celebrando los sacramentos.
El 22 de diciembre de 1913, el padre Francesco sufrió un infarto en una estación de tren, de regreso a casa. Entre sus últimas palabras estuvieron: «Me preparo para el paraíso». El padre Francesco di Francia falleció esa misma noche, rodeado de religiosas de la orden que él mismo había fundado. Su hermano, el padre Aníbal, no se enteró de su muerte hasta la víspera de Año Nuevo.
El padre Francesco fue proclamado Venerable por el Papa Francisco el 19 de marzo de 2019, festividad de San José.
